Profesör Aronnaks ve iki arkadaşı bu olayı araştıran gemiyle yola çıkarlar. Sonunda sözü edilen canavarla karşılaşırlar. Canavar gemiye saldırır ve kahramanlarımız denize düşerler. Sonra da kendilerini canavar zannedilen şeyin üzerinde bulurlar. Bu bir denizaltıdır. İşte böylece Kaptan Nemo'nun ünlü denizaltısı Natilüs'deki inanılmaz mâcera başlar.